Павел А. Крылов, Алия А. Абдулова, Олег В. Пермяков, Валерий В. Новочадов СТРУКТУРНО-ФУНКЦИОНАЛЬНЫЙ АНАЛИЗ МАРГАНЕЦ- И ЦИНК-ЗАВИСИМЫХ БЕЛКОВ У РАСТЕНИЙ, ПРОИЗРАСТАЮЩИХ НА ЮГЕ РОССИИ

DOI: https://doi.org/10.15688/nsr.jvolsu.2022.1.6 

Крылов Павел Андреевич, кандидат биологических наук, доцент кафедры биологии и биоинженерии, Волгоградский государственный университет, просп. Университетский, 100, 400062 г. Волгоград, Российская Федерация, Этот адрес электронной почты защищен от спам-ботов. У вас должен быть включен JavaScript для просмотра. .
Абдулова Алия Аликовна, студент кафедры биологии и биоинженерии, Волгоградский государственный университет, просп. Университетский, 100, 400062 г. Волгоград, Российская Федерация Этот адрес электронной почты защищен от спам-ботов. У вас должен быть включен JavaScript для просмотра.
Пермяков Олег Валерьевич, аспирант кафедры биологии и биоинженерии, Волгоградский государственный университет, просп. Университетский, 100, 400062 г. Волгоград, Российская Федерация, Этот адрес электронной почты защищен от спам-ботов. У вас должен быть включен JavaScript для просмотра.
Новочадов Валерий Валерьевич, доктор медицинских наук, профессор, кафедры биологии и биоинженерии, Волгоградский государственный университет, просп. Университетский, 100, 400062 г. Волгоград, Российская Федерация, Этот адрес электронной почты защищен от спам-ботов. У вас должен быть включен JavaScript для просмотра.


Аннотация. Современные биоинформационные подходы позволяют проводить структурно-функциональный анализ белков различных организмов на наличие гомологичных и негомологичных участков. Данное исследование направлено на выявление структурно-функциональных различий марганец- и цинк-зависимых белков у распространенных видов растений, произрастающих на территории аридных биоценозов Юга России. Основной целью работы являлось изучение наличия марганец- и цинк-зависимых белков, входящих в протеом распространенных видов растений, типичных для аридных территорий Юга России. В результате анализа протеома растений на наличие марганец- и цинк-зависимых белков было обнаружено, что степень изученности очень низка, число аннотированных белков составило 5 штук только для Artemisia annua и Artemisia lercheana, в то время как для других видов аннотация белков вообще отсутствовала. В дальнейшем с помощью биоинформационного поиска было обнаружено наличие общего у всех растений марганец-завимимого белка Photosystem II protein D1 и цинк-зависимого Acetyl-CoA carboxylase carboxyl transferase subunit beta. Структурный анализ последовательностей с помощью множественного выравнивания показал, что имеются сильные структурные различия в марганец-зависимом белке Photosystem II protein D1 между Artemisia lercheana, Artemisia annua, Cichorium intybus, Descurainia sophia, Tripleurospermum inodorum и Xanthium albinum, а для цинк-зависимого белка Acetyl-CoA carboxylase carboxyl transferase subunit beta – у Artemisia lercheana, Artemisia annua, Cichorium intybus и Descurainia sophia, что связано с множеством замен аминокислот, в том числе консервативных и слабоконсервативных участков. Полученные результаты исследования показали низкую степень изученности и описания структурно-функциональных свойств металл-зависимых белков у доминирующих растений, произрастающих на Юге России.

Ключевые слова: металл-зависимые белки, марганец, цинк, биоинформатика, множественное выравнивание, растения Юга России.

Цитирование. Крылов П. А., Абдулова А. А., Пермяков О. В., Новочадов В. В. Структурно-функциональный анализ марганец- и цинк-зависимых белков у растений, произрастающих на Юге России // Природные системы и ресурсы. – 2022. – Т. 12, № 1. – С. 45–53. – DOI: https://doi.org/10.15688/nsr.jvolsu.2022.1.6

Лицензия Creative CommonsЭто произведение доступно полицензии Creative Commons «Attribution» («Атрибуция») 4.0 Всемирная.

Вложения:
Скачать этот файл (6_Krylov etc.pdf) 6_Krylov etc.pdf
URL: https://ns.jvolsu.com/index.php/ru/component/attachments/download/802
27 Скачивания