Анастасия А. Корчагина, Павел А. Крылов ФИЛОГЕНЕТИЧЕСКИЙ АНАЛИЗ СТРУКТУР ADAMTS-4 И ADAMTS-5

DOI: https://doi.org/10.15688/nsr.jvolsu.2020.1.1

Анастасия Александровна Корчагина, студент кафедры биоинженерии и биоинформатики, Волгоградский государственный университет, просп. Университетский, 100, 400062 г. Волгоград, Российская Федерация, Этот адрес электронной почты защищен от спам-ботов. У вас должен быть включен JavaScript для просмотра. .
Павел Андреевич Крылов, кандидат биологических наук, доцент кафедры биоинженерии и биоинформатики, Волгоградский государственный университет, просп. Университетский, 100, 400062 г. Волгоград, Российская Федерация, Этот адрес электронной почты защищен от спам-ботов. У вас должен быть включен JavaScript для просмотра. .


Аннотация. ADAMTS-4 и -5 являются аггреканазами, которые участвуют в развитии остеоартроза путем разрушения аггрекана в различных сайтах связывания, из которых наиболее важную роль в патогенезе играет расщепление в связи Glu373-Ala374. Поэтому их изучение является актуальной задачей и по сей день. В настоящий момент уже изучены структурные особенности данных ферментов, однако не достаточно понятно влияние эволюционного развития на их функции и ферментативную активность. В данной работе были проведены исследования insilico. Они заключаются в построении филогенетических деревьев методом максимального правдоподобия в программе MEGA X, установлении изменений в структурах, произошедших в процессе эволюции, и их возможное влияние на ферментативную активность. Помимо этого, был определен организм, наиболее подходящий для экспериментальных исследований. В ходе данного исследования для анализа эволюционных изменений были изучены последовательности организмов из различных семей: Лосось, Цесарка, Лягушка, Питон, Кролик, Леопард, Горилла, Человек. Длины данных последовательностей приблизительно равны, при выравнивании структуры не сильно отличаются. При исследовании построенных по данным последовательностям деревьев было обнаружено, что их структура сильно отличается только в начале, в районе сигнальной поверхности и продомена, в остальной же части изменения незначительны. Также был проведен анализ филогенетических деревьев для определения организма, обладающего наиболее схожей с человеческой структурой и следовательно наиболее подходящего для исследований in vivo. Были исследованы структуры: Бык, Верблюд, Свинья, Осел, Кролик, Крыса, Мышь, а также Человек. Наиболее схожей структурой обладает кролик и следовательно он является более подходящим для экспериментальных исследований.

Ключевые слова: ADAMTS-4, ADAMTS-5, филогенетические деревья, структура, домены, остеоартроз.
Цитирование. Корчагина А. А., Крылов П. А. Филогенетический анализ структур ADAMTS-4 и ADAMTS-5 // Природные системы и ресурсы. – 2020. – Т. 10, № 1. – С. 5–11. – DOI: https://doi.org/10.15688/nsr.jvolsu.2020.1.1

 Лицензия Creative CommonsЭто произведение доступно по лицензии Creative Commons «Attribution» («Атрибуция») 4.0 Всемирная.

Вложения:
Скачать этот файл (1_Korchagina_Krylov.pdf) 1_Korchagina_Krylov.pdf
URL: https://ns.jvolsu.com/index.php/ru/component/attachments/download/614
233 Скачивания