Крылов П.А., Исаков А.С., Несмеянова Е.Н., Бороздина Н.А., Постнова М.В., Новочадов В.В. Анализ протеома доминирующих видов микроорганизмов в агробиоценозах Волгоградской области на наличие никель и кобальт зависимых белков

DOI: https://doi.org/10.15688/nsr.jvolsu.2018.4.3

 
Павел Андреевич Крылов
кандидат биологических наук, ассистент кафедры биоинженерии и биоинформатики, Волгоградский государственный университет
просп. Университетский, 100 400062 г. Волгоград, Российская Федерация
Этот адрес электронной почты защищен от спам-ботов. У вас должен быть включен JavaScript для просмотра.
 
Артем Сергеевич Исаков
студент кафедры биоинженерии и биоинформатики, Волгоградский государственный университет
просп. Университетский, 100 400062 г. Волгоград, Российская Федерация
Этот адрес электронной почты защищен от спам-ботов. У вас должен быть включен JavaScript для просмотра.
 
Елена Николаевна Несмеянова
студент кафедры биоинженерии и биоинформатики, Волгоградский государственный университет
просп. Университетский, 100 400062 г. Волгоград, Российская Федерация
Этот адрес электронной почты защищен от спам-ботов. У вас должен быть включен JavaScript для просмотра.
 
Наталья Андреевна Бороздина
студент кафедры биоинженерии и биоинформатики, Волгоградский государственный университет
просп. Университетский, 100 400062 г. Волгоград, Российская Федерация
Этот адрес электронной почты защищен от спам-ботов. У вас должен быть включен JavaScript для просмотра.
 
Маргарита Викторовна Постнова
доктор биологическихз наук, доцент, зав. кафедрой биоинженерии и биоинформатики, Волгоградский государственный университет
просп. Университетский, 100 400062 г. Волгоград, Российская Федерация
Этот адрес электронной почты защищен от спам-ботов. У вас должен быть включен JavaScript для просмотра.
 
Валерий Валерьевич Новочадов
доктор медицинских наук, профессор, директор института естественных наук, Волгоградский государственный университет
просп. Университетский, 100 400062 г. Волгоград, Российская Федерация
Этот адрес электронной почты защищен от спам-ботов. У вас должен быть включен JavaScript для просмотра.
 
Аннотация. Использование современных биоинформационных подходов для решения эколого-ориентированных задач обеспечивает получение новых данных, которые можно использовать для импактного управления агроценозами и экосистемами, восстанавливая их нарушения, обусловленные действием неблагоприятных факторов естественной и антропогенной среды. Данная работа направлена на выявление и определение никель и кобальт зависимых белков в доминирующих видах микроорганизмов агроценозе, что позволяет создать информационную базу для накопления и обработки сведений о закономерностях функционирования микроорганизмов в сельскохозяйственных системах аридной зоны, что будет способствовать повышению эффективности природопользования. Основно протеом доминирующих видов микроорганизмов типичных агроценозов Волгоградской области. Никель и кобальт зависимые белки были разделены по функциональным особенностям, таких как участие в метаболизме, гидролитической активности, транспорте и регуляции экспрессии генов и синтезе белков. Результаты виртуального скрининга протеома доминирующих микроорганизмов рода Bacillus и Actinomyces в базе Uniprot, показали, что для почвенной микробиоты рассмотренного агроценоза также характерно достаточно большое количество металлзависимых белков: 264 – для представителей Рода Actinomyces и 564 – для Bacillus subtilis, из которых примерно 35–40 % аннотированы. Полученные результаты свидетельствуют, что концентрация металлов в почве агроценоза является значимым фактором воздействия на жизнедеятельность микроорганизмов в почве. Полученные результаты можно использовать как основу для осуществления адресного высокоточного управления биоценозами с целью повышения устойчивости природных сообществ и экономической эффективности агроценозов.
Ключевые слова: агроценозы, протеом, никель, кобальт, металлзависимые белки, сельскохозяйственное природопользование, база данных.
Creative Commons License
Анализ протеома доминирующих видов микроорганизмов в агробиоценозах Волгоградской области на наличие никель и кобальт зависимых белков by Крылов П.А., Исаков А.С., Несмеянова Е.Н., Бороздина Н.А., Постнова М.В., Новочадов В.В. is licensed under a Creative Commons Attribution 4.0 International License.
Вложения:
Скачать этот файл (3_Krylov_i_dr.pdf) 3_Krylov_i_dr.pdf
URL: https://ns.jvolsu.com/index.php/ru/component/attachments/download/546
232 Скачивания